Le train ne constitue pas un moyen réaliste de rejoindre Sarajevo depuis la France, la Belgique ou la Suisse. Le réseau bosnien a perdu presque toutes ses relations avec les pays voisins. Un voyageur venu d'Europe de l'Ouest atteint au mieux Zagreb ou Belgrade par le rail, puis termine en autocar.
Une seule relation internationale fonctionne, entre Sarajevo et Ploce, sur la côte croate, par Mostar et Capljina. Elle circule de façon saisonnière, en été, du vendredi au dimanche, en trois heures vingt environ. Ploce forme un cul-de-sac ferroviaire, sans correspondance vers le reste de l'Europe. La liaison entre Zagreb et Sarajevo est suspendue depuis 2016. Les deux pays discutent de son rétablissement, sans calendrier confirmé. La relation avec Belgrade est interrompue depuis bien plus longtemps.
Le réseau intérieur se limite à deux axes.
Les relations vers Banja Luka et vers Tuzla ne sont plus assurées. L'autocar les remplace.
Sur place, le train garde tout son sens pour un trajet précis. La ligne qui descend vers l'Adriatique suit la vallée de la Neretva et traverse des gorges spectaculaires. Les rames Talgo, climatisées et confortables, tranchent avec le reste du réseau et disposent d'un bar. Le prix reste bas, et le trajet vaut autant pour le paysage que pour le déplacement.
Les tarifs sont modestes. Le Sarajevo-Mostar coûte un peu plus de quatorze marks convertibles en seconde classe, soit environ sept euros, avec une réduction sur l'aller-retour. Le billet pour Ploce avoisine trente marks. La vente en ligne existe sur le site des chemins de fer de la Fédération, mais elle ne couvre pas toutes les relations, et le billet se retire ensuite au guichet. Le guichet de la gare reste la solution la plus simple. La réservation n'est pas nécessaire sur les trains intérieurs, le placement étant libre.
La gare centrale se situe dans le quartier de Novo Sarajevo, à l'ouest du centre historique, sur la même esplanade que la gare routière principale. Le tramway et le trolleybus la relient à Bascarsija en une vingtaine de minutes. Le bâtiment paraît démesuré au regard du trafic actuel, qui se compte en quelques trains par jour. La consigne à bagages se trouve dans la gare routière voisine.